Системы белкового мечения SNAP- и CLIP-tag позволяют осуществлять специфическое, ковалентное присоединение практически любой молекулы к интересующему белку. Использование этой системы включает два этапа: клонирование и экспрессию целевого белка в виде гибридного белка со SNAP-tag®, а также мечение этого гибридного белка выбранным субстратом SNAP-tag.
SNAP-tag представляет собой небольшой белок, основанный на человеческом ферменте O6-алкильгуанин-ДНК-алкилтрансферазе (hAGT), участвующем в репарации ДНК. Субстраты SNAP-tag — это красители, флуорофоры, биотин или микросферы, конъюгированные с гуанином или хлорпиримидином через бензильный линкер. В процессе мечения замещённая бензильная группа субстрата ковалентно присоединяется к SNAP-tag.
CLIP-tag™ — это модифицированная версия SNAP-tag, созданная для взаимодействия с бензилцитозиновыми, а не с бензилгуаниновыми производными. При совместном использовании SNAP-tag и CLIP-tag обеспечивается ортогональное и комплементарное мечение двух различных белков одновременно в одних и тех же клетках.
